Биоинформатики Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ и Калифорнийского университета создали ассемблер metaviralSPAdes, сообщает пресс-служба петербургского вуза.
Новый сборщик позволяет найти и собрать геном вируса среди множества других последовательностей.
Благодаря новой технологии ученые смогут быстрее расшифровывать геномы патогенов, что позволит скорее приступить к разработке вакцин и тест-систем от опасных инфекций, включая коронавирус.
«Пандемия COVID-19 стала тревожным звонком для биологов, изучающих передачу вирусов от животных к человеку, и напомнила, насколько важно исследовать различных хозяев вирусов, например, летучих мышей», — рассказали в вузе.
Специалисты подчеркивают, что во время вспышки коронавируса очень сложно производить секвенирование. Например, в слюне пациента с COVID-19 содержатся геномы многих других вирусов.
